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作者: 小布丁大更新時(shí)間:2024-07-26
各種裂解液中的破膜組分主要用于細胞裂解,以便釋放細胞內部的蛋白質(zhì)、核酸和其他生物分子。細胞裂解液的主要目的:1.利用去污劑破壞脂質(zhì)雙分子層,破裂細胞;2. 溶解蛋白;3. 蛋白變性使其穩定;4. 抑制蛋白酶活性
關(guān)于去垢劑 (detergents):
幾種組織/細胞裂解液裂解強度(應用)的差異主要還是配方中去污劑種類(lèi)和濃度的不同。去污劑分為變性去污劑(denaturing detergents)和非變性去污劑(non-denaturing detergents),前者可以是陰離子,比如SDS;或陽(yáng)離子,比如乙基三甲基溴化銨。這些去垢劑總體來(lái)說(shuō)破壞膜和通過(guò)打破蛋白-蛋白間相互作用來(lái)變性蛋自;非變性去垢劑分為非離子,比如Titon X-100;膽鹽,比如膽酸鹽類(lèi);和兩性離子去垢劑,比如CHAPS。
不同類(lèi)型的裂解液和其破膜組分具有不同的功能和特點(diǎn):
例如,在免疫沉淀或ELISA實(shí)驗中,Tween 20常用于洗脫非特異性結合的蛋白質(zhì),以減少背景信號,提高實(shí)驗的特異性和靈敏度。在蛋白質(zhì)提取和純化過(guò)程中,可以防止蛋白質(zhì)的非特異性吸附和變性,幫助保持蛋白質(zhì)的穩定性。CHAPS常用于保持蛋白質(zhì)活性和結構的同時(shí)破裂膜結構,適用于功能分析。Digitonin作為一種溫和的去污劑,可以選擇性地溶解包含膽固醇的膜,如細胞膜和線(xiàn)粒體外膜,但對線(xiàn)粒體內膜影響較小。這使得它特別適合用于區分和分離線(xiàn)粒體外膜和內膜。常用于選擇性地提取線(xiàn)粒體外膜,同時(shí)保持內膜的完整性。相比于其他去污劑,Digitonin的作用較為溫和,能夠在保持蛋白質(zhì)活性的同時(shí)提取膜蛋白,這對于需要保留蛋白質(zhì)功能的實(shí)驗非常重要。NP-40是很溫和的去垢劑,1%濃度的基本可以破壞掉胞膜,而對核膜破壞的作用弱,結合特定的buffer可以獲得胞漿蛋白。
TritonX-100的能力介于NP40和SDS之間,偏向于NP40,溶解脂質(zhì),增加細胞膜的通透性,也是常用的細胞裂解液成分之一,在保護蛋白活性方面有一定作用(SDS基本會(huì )使蛋白變性失活)。但是去垢劑屬性只是一方面,buffer、配比、濃度、提取方法和材料處理也都是關(guān)鍵因素。
2. 陰離子型去污劑(如SDS, Deoxycholate):
? 能有效溶解細胞膜及蛋白質(zhì),常用于徹底裂解細胞,提取總蛋白質(zhì)。
? 會(huì )使蛋白質(zhì)變性,適合用于SDS-PAGE和Western Blot等實(shí)驗。
例如,去氧膽酸鈉能有效地破壞細胞膜和核膜,廣泛用于總蛋白質(zhì)提取。在裂解細胞和組織時(shí),它能夠幫助溶解細胞膜中的脂質(zhì)成分,釋放細胞內容物。因此,常用于溶解和提取膜蛋白。相比于非離子型去污劑,它能夠更加徹底地溶解難以提取的膜蛋白。
SDS屬于陰離子型去垢劑,最厲害,基本可以把細胞完全破掉,DNA會(huì )釋放出來(lái),裂解液變得很粘稠。
去氧膽酸鈉有時(shí)與其他去污劑(如SDS)聯(lián)合使用,以增強去污和蛋白質(zhì)溶解效果。在某些情況下,與非離子型去污劑(如Triton X-100)聯(lián)合使用,可以兼顧蛋白質(zhì)溶解和活性保持。
常見(jiàn)的細胞裂解液成分:
50mM Tris-HCl pH7.4 (緩沖體系)
150mM NaCl (等滲體系)
1mM PMSF (蛋白酶抑制劑)
1mM EDTA (變性劑和穩定劑)
5μg/ml Aprotinin (蛋白酶抑制劑)
5μg/ml Leupeptin (蛋白酶抑制劑)
1% Triton X-100 (弱變性劑)
0.1% SDS (強變性劑和溶解劑)
1% Sodium deoxycholate (中度變性劑和溶解劑)
一些常用裂解液的主要特點(diǎn)和差異:
用于普通的Western、IP或co-IP,通常使用Western及IP細胞裂解液。裂解細胞或組織后,沒(méi)有非常粘滯的透明狀DNA團塊形成,不必采用超聲處理等就可以非常理想地用于后續操作。另外該裂解液裂解的產(chǎn)物也適合用于磷酸化蛋白的Western檢測。
對于某些特殊蛋白的IP,如果發(fā)現Western及IP細胞裂解液)效果不是非常理想,可以嘗試用RIPA裂解液(強、中或弱)或NP-40裂解液。如果發(fā)現IP的時(shí)候背景很高,即非特異的蛋白也被IP下來(lái),則需要選用裂解強度較高的裂解液,例如RIPA裂解液(強或中)。如果發(fā)現目的蛋白無(wú)法被IP下來(lái),則說(shuō)明裂解液的強度過(guò)強,可以使用較為溫和的裂解液例如RIPA裂解液(弱)或NP-40裂解液。
對于某些難溶解蛋白的Western,如果發(fā)現Western及IP細胞裂解液效果不是非常理想,可以嘗試使用裂解強度更高的裂解液例如RIPA裂解液(強、中)或SDS裂解液。
用于特定用途需要自行添加特定抑制劑或不需要添加抑制劑時(shí),可以考慮最后兩種。用Western及IP細胞裂解液(無(wú)抑制劑)在很多時(shí)候可以兼容酶活性和生物小分子的檢測,對于特定的酶或生物小分子的檢測是否兼容需要自行測試。Western及IP細胞裂解液(無(wú)抑制劑)的裂解能力比RIPA裂解液(強,無(wú)抑制劑)弱一些,但用于酶活性和生物小分子時(shí),兼容性通常會(huì )更好一些。
蛋白酶抑制劑:抑制蛋白酶的活性,避免蛋白過(guò)度降解。
3. 裂解酶(如Lysozyme, Trypsin):
? 針對特定類(lèi)型的細胞,如細菌細胞,能夠降解細胞壁成分,使細胞膜易于裂解。
? 常與其他裂解劑聯(lián)合使用,增強裂解效果。
4. 機械破碎法(如超聲波裂解、玻璃珠研磨):
? 不依賴(lài)化學(xué)裂解液,適用于堅硬的細胞壁(如酵母和植物細胞)。
? 可通過(guò)控制處理強度和時(shí)間調節裂解效果。
5. 高滲或低滲裂解(如低鹽緩沖液):
? 利用滲透壓差導致細胞脹裂或收縮破裂,適合裂解脆弱的細胞類(lèi)型。
? 通常配合其他裂解方法使用,以提高效率。
6. 有機溶劑(如乙醇、乙酸乙酯):
? 能溶解脂質(zhì)膜,但可能對蛋白質(zhì)有較大破壞作用。
? 適用于某些特定實(shí)驗,如脂質(zhì)分析。
選擇合適的裂解液及其破膜組分,取決于具體的實(shí)驗目的和細胞類(lèi)型。確保實(shí)驗條件不會(huì )破壞目標分子的活性或結構,是進(jìn)行成功實(shí)驗的關(guān)鍵。
(來(lái)源 微信公眾號:“科研這點(diǎn)事兒”)