細菌是否有芽孢以及芽孢的形狀和位置都是細菌的重要特征，細菌的芽孢壁比營(yíng)養細胞的細胞壁結構復雜、致密、通透性低，著(zhù)色和脫色都比營(yíng)養細胞困難。芽孢有很強的抗熱和抗化學(xué)物質(zhì)的特性，當采用堿性染料并加熱或延長(cháng)染色時(shí)間時(shí)，使菌體和芽孢都能著(zhù)色，再用蒸餾水沖洗脫去菌體顏色，但芽孢的顏色仍然可以保留，可以在顯微鏡下明顯區分芽孢和營(yíng)養體的形態(tài)。

Leagene芽孢晶體染色液主要由石炭酸、乙醇、品紅等組成，芽孢晶體會(huì )被染成紅色，菌體呈紅色，可以判斷某些芽孢桿菌產(chǎn)生堿溶性蛋白晶體(伴孢晶體)，但應注意觀(guān)察芽孢應在成熟期，但也不能過(guò)久，否則只能看到芽孢，而營(yíng)養體已經(jīng)消失。該試劑僅用于科研領(lǐng)域，不適用于臨床診斷或其他用途。